Ο Μανούσος Μανουσάκης γεννήθηκε το 1950 στην Αθήνα. Σπούδασε σκηνοθεσία στη Σχολή Κινηματογράφου του Λονδίνου (London Film School) στην Αγγλία. Όταν επέστρεψε στην Ελλάδα στις αρχές της δεκαετίας του 1970 ξεκίνησε να εργάζεται αρχικά στον κινηματογράφο.
Μία από τις πρώτες του δουλειές ήταν η ταινία Βαρθολομαίος το 1973. Στην ταινία αυτή είχε τριπλό ρόλο καθώς έγραψε το σενάριο και έκανε την σκηνοθεσία και την παραγωγή αυτής. Η ταινία απέσπασε ειδική μνεία στο Φεστιβάλ Κινηματογράφου Σαν Ρέμο του 1973, ωστόσο στην Ελλάδα απαγορεύτηκε από τη χούντα.
Ακολούθησαν κι άλλες κινηματογραφικές παραγωγές όπως το Άρχοντες το 1978, Η σκιάχτρα το 1985, ενώ συμμετείχε στις ταινίες Σουβλίστε τους!, Έτσι θα πάρουμε το κουραδόκαστρο και Το τραγούδι της επιστροφής, όπου είχε παρουσία ως ηθοποιός.
Σκηνοθετικά έχει υπογράψει και τις ταινίες Παραλάβατε διορισμόν το 1996, Κόκκινος δράκος το 1998 και Ουζερί Τσιτσάνης το 2015.
Στα μέσα τις δεκαετίας του 1980 έκανε τα πρώτα του βήματα ως σκηνοθέτης τηλεοπτικών σειρών. Πιο συγκεκριμένα ανέλαβε την σκηνοθεσία των σειρών Καλλικαντζαροδουλειές (1985-1986), Μικρογραφίες (1986-1987) και Τα καλύτερά τους χρόνια (1989).
Το όνομά του έχει συνδεθεί με τη σκηνοθεσία και παραγωγή ελληνικών τηλεοπτικών σειρών στην ιδιωτική τηλεόραση, διαγράφοντας μία λαμπρή πορεία από τις αρχές του 1990 μέχρι σήμερα. Οι περισσότερες σειρές που έχει υπογράψει στην τηλεόραση ήταν δραματικές και μιλούν για απαγορευμένους έρωτες. Κάποιες, μάλιστα, όπως οι Ψίθυροι καρδιάς, το Άγγιγμα ψυχής, το Μη μου λες αντίο, το Η αγάπη ήρθε από μακριά, θεωρούνται από τις πιο επιτυχημένες στην ιστορία της ελληνικής τηλεόρασης.
Η τελευταία τηλεοπτική δουλειά του κορυφαίου σκηνοθέτη ήταν Το Δίχτυ, που πρόσφατα έκανε πρεμιέρα στην ΕΡΤ1 και προβάλλεται κάθε Παρασκευή στις 22:00. Ετοιμαζόταν, μάλιστα, για τα γυρίσματα του δεύτερου κύκλου της σειράς, με νέες αυτοτελείς αστυνομικές ιστορίες. Δεν τα κατάφερε. Σύμφωνα με πληροφορίες, το τελευταίο διάστημα ο Μανούσος Μανουσάκης νοσηλευόταν με προβλήματα υγείας στο νοσοκομείο Υγεία.
Τα συλλυπητήρια της Υπουργού Πολιτισμού, Λίνας Μενδώνη[…] «Ο Μανούσος Μανουσάκης έκανε ποιοτική τηλεόραση για το ευρύ κοινό, χωρίς εκπτώσεις στις απαιτήσεις του, αλλά και χωρίς να εγκαταλείψει το σινεμά, στο οποίο, επιλεκτικά, επανερχόταν με άρτιες δημιουργίες. Καθοδήγησε με σοφία και προσωπικό ενδιαφέρον πολλούς νέους καλλιτέχνες, δίνοντας ώθηση στην ανάδειξή τους. Συνεργάστηκε αρμονικά με καταξιωμένους συναδέλφους του, κάτι που εξηγεί, πέραν της δημοφιλίας του, την αγάπη και τον σεβασμό με τον οποίο τον περιέβαλε ο χώρος. Το καλλιτεχνικό αποτύπωμά του πίσω από τον φακό μένει ανεξίτηλο. Στην οικογένειά του και τους φίλους του απευθύνω ειλικρινέστατα συλλυπητήρια».
Συγγενείς, φίλοι, συνεργάτες και όσοι τον αγάπησαν μέσα από τις δουλειές του θα έχουν την ευκαιρία να αποχαιρετήσουν τον σπουδαίο σκηνοθέτη το Σάββατο 23 Νοεμβρίου στις 13.00, στο Α’ Νεκροταφείο Αθηνών, όπου θα γίνει η κηδεία του.